Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl41A2AUC9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms