Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SktA2AQ25 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms