Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam205aA2APU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms