Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GabreA2AMW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms