Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FocadA2AKG8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms