Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc183A2AJB1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms