Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prdm12A2AJ77 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prdm12A2AJ77 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm12A2AJ77 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms