Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Brwd3A2AHJ4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brwd3A2AHJ4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brwd3A2AHJ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brwd3A2AHJ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms