Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmpd4A2AFR3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd4A2AFR3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms