Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700023F06RikA2AB62 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms