Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd5A2A8L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd5A2A8L1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms