Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm27029A2A4P4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm27029A2A4P4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm27029A2A4P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms