Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6268A2A3U9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6268A2A3U9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6268A2A3U9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms