Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C8

Gm5089, EG328479 protein, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5089A1L3C8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5089A1L3C8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5089A1L3C8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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