Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms