Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc112A0AUP1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms