Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms