Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a4Q9Z306 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a4Q9Z306 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms