Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms