Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms