Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp1Q9Z273 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp1Q9Z273 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms