Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApomQ9Z1R3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ApomQ9Z1R3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms