Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VarsQ9Z1Q9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VarsQ9Z1Q9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms