Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms