Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Supt4h1bQ9Z199 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms