Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Itsn1Q9Z0R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itsn1Q9Z0R4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms