Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clip2Q9Z0H8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms