Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PapolbQ9WVP6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms