Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tusc2Q9WVF8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tusc2Q9WVF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms