Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mixl1Q9WUI0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms