Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms