Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf13bQ9WU72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms