Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax2Q9WTP9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms