Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam50bQ9WTJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms