Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf7Q9R1C0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf7Q9R1C0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms