Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt9Q9R0N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt9Q9R0N9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms