Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Plod1Q9R0E2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms