Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsjQ9R014 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms