Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp21Q9QZL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms