Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk3Q9QZL0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk3Q9QZL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms