Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClnkQ9QZE2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms