Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clic4Q9QYB1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms