Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VapbQ9QY76 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms