Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp1Q9QY53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms