Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan3Q9QY33 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan3Q9QY33 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tspan3Q9QY33 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tspan3Q9QY33 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms