Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms