Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms