Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip4Q9QXN3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.6 ms