Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpsf3Q9QXK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpsf3Q9QXK7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cpsf3Q9QXK7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpsf3Q9QXK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms