Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChmQ9QXG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms